Produse

Spectroscopia în infraroșu a fost utilizată pentru a mapa interacțiunile substrat-proteină: modificările conformaționale ale reticulului sarcoplasmatic Ca(2+)-ATPazei la legarea nucleotidelor și fosforilarea ATPazei au fost monitorizate utilizând substratul ATP și analogii ATP (2'-deoxi-ATP, 3). '-deoxi-ATP și inozină 5'-trifosfat), care au fost modificate la grupuri funcționale specifice ale substratului.Modificările la 2’-OH, 3’-OH și gruparea amino a adeninei reduc amploarea modificării conformaționale induse de legare a ATPazei, cu efecte deosebit de puternice observate pentru ultimele două.Acest lucru demonstrează sensibilitatea structurală a complexului nucleotidă-ATPază la interacțiunile individuale dintre nucleotide și ATPază.Toate grupurile studiate sunt importante pentru legarea și interacțiunile unui grup dat de ligand cu ATPaza depind de interacțiunile altor grupări de ligand.Fosforilarea ATPazei a fost observată pentru ITP și 2'-deoxi-ATP, dar nu pentru 3'-deoxi-ATP.Nu există o legătură directă între amploarea modificării conformaționale la legarea nucleotidelor și rata de fosforilare, ceea ce arată că întreaga amploare a modificării conformaționale induse de ATP nu este obligatorie pentru fosforilare.După cum sa observat pentru complexul nucleotidă-ATPază, conformația primului intermediar ATPază fosforilat E1PCa(2) depinde, de asemenea, de nucleotidă, ceea ce indică faptul că stările ATPazei au o conformație mai puțin uniformă decât se anticipa anterior.